劇情

提阿瑪特彗星（ティアマト彗星）每逢1200年造訪地球，在深山小鎮糸守町（糸守町／いともりまち）中家族世代經營鎮內「宮水神社」的高中少女宮水三葉、以及東京四谷的高中少年立花瀧，從某天開始，在睡覺的時候，就會靈魂互換，醒來什麼都不記得，感覺像做了奇妙的夢，但周圍的人會講出他們昨天有違平常。他倆很快意識到這種情形，困惑之中開始在彼此手機留言，逐漸地變得習慣於身體切換，並干預對方的生活。三葉不僅樂於所嚮往的東京生活，也利用女人心這點，幫助瀧更接近其打工的美女前輩奧寺，促成與她約會；而瀧以陽剛的形象，幫助柔弱的三葉在她的學校更受歡迎，雙方逐漸對彼此有好感。有次三葉（瀧）和妹妹四葉、外祖母一起徒步至宮水神社位在鎮外山上的「御神體」，途中外祖母告訴她們：「產靈」、「ムスビ」、「結」都可以連結人與時間，在本質上是相同的，因此宮水家族的歷代巫女都編織結繩來體現，水酒等進入人體也能和時間形成連結。三人參拜位於破火山口型窪地「隱世」（カクリヨ）上的御神體，並以口嚼酒為半身獻祭。回程時當三葉（瀧）和妹妹四葉、外祖母在觀看糸守湖的夕陽時，外祖母對三葉（瀧）說：「你是不是在作夢？」，瀧聽完後從床上驚醒起來，並發覺自己在流淚。 瀧與奧寺約會時，偶然看到飛驒市照片喚起記憶，三葉留下信息告訴瀧約會後正好可以看到彗星，瀧覺得此話十分奇怪，決定打電話詢問卻打不通，而且自那天起就再也沒有跟三葉交換身體。心中充滿疑問的他利用擅長的素描畫下片段印象，並與同學藤井司、前輩奧寺一起去飛驒探個究竟。在瀧一行人拿著素描詢問當地居民但四處碰壁之際，遇上拉麵店老闆閒聊回憶起家鄉，得知該地名為「糸守町」，並在拉麵店老闆的帶領下來到已無人居住的原糸守町區域；由於三年前提阿瑪特彗星分裂出來的彗星擊中當時正在舉行秋日祭典的宮水神社一帶，村鎮被摧毀大半，超過500名鎮民、包括宮水本家及其朋友皆不幸罹難。不相信這個事實的瀧打開手機，卻發現三葉的留言全部消失，而歷史文獻亦將她列在罹難者名單之中。當天晚上和奧寺談起瀧手上不知何來的結繩信物時，瀧想到三葉外祖母曾經說過土地神可以連結人與時間，便決定前去糸守町尋找和三葉以及彗星墜落有關的事物。他留下字條跟藤井司、奧寺說明原因後，在拉麵店老闆的幫助下前往糸守町的御神體。